בתי הדין מבצעים ביקורת שיפוטית על צווי משמורת שמוציא ממונה ביקורת הגבולות במשרד הפנים.  בתי הדין אינם מוסמכים לדון בצווי ההרחקה מהארץ. החוק קובע כי אין מרות על בית הדין זולת מרותו של החוק.

בתי הדין מוסמכים לאשר את צו המשמורת, לשנותו או לבטלו. העילות לשחרור מוחזק ממשמורת מנויות בחוק, והן:

1. השתכנע ביה"ד כי שהייתו הבלתי חוקית של מוחזק יסודה בטעות או בתקלה שבתום לב,
   וכי יצא מישראל במועד שקבע לו;
2. השתכנע ביה"ד כי המוחזק יצא מישראל בעצמו בתוך מועד שקבע לו, וכי לא יהיה קושי באיתורו אם לא יצא בעצמו במועד שנקבע;
3. השתכנע ביה"ד כי מחמת גילו או מצב בריאותו של המוחזק החזקתו במשמורת עלולה לגרום נזק לבריאותו, או שקיימים טעמים הומניטריים מיוחדים אחרים המצדיקים את שחרורו בערובה, לרבות מקום שעקב החזקה במשמורת ייוותר קטין בלא השגחה;
4. המוחזק שוהה במשמורת יותר מ-60 ימים ברציפות.

חרף עילות אלה קובע החוק כי לא ישוחרר מוחזק ממשמורת אם:

1. הרחקתו מישראל נמנעת או מתעכבת בשל העדר שיתוף פעולה מלא מצדו, לרבות לענין 
   הבהרת זהותו או להסדרת הליכי הרחקתו מישראל;
2. יש בשחרורו כדי לסכן את ביטחון המדינה, את שלום הציבור או את בריאות הציבור.

בהתאם להנחיות היועץ המשפטי לממשלה, מובא כל שוהה שלא כדין המוחזק במשמורת לדיון בפני בית דין עד לא יאוחר מארבעה ימים מיום תחילת המשמורת.

ערעור על החלטות בתי הדין מוגש כערעור מינהלי (עמ"נ) לבית המשפט המחוזי בשבתו כבית משפט לעניינים מינהליים.

בתי הדין יושבים בשלושה מתקני משמורת: מעשיהו (רמלה) מיכ"ל (חדרה) וקציעות.  כיום מכהנים בבתי הדין חמישה דיינים:

עו"ד שרה בן שאול – וייס,

עו"ד אלעד אזר,

עו"ד רות גרינברג

עו"ד דן ליברטי,

עו"ד תומר כרמי;

הדיינים מונו לתפקיד בהתאם להוראות ס' 13 יא' לחוק.

מזכירות בתי הדין במתקן מעשיהו פועלת בימים א' עד ה' בין השעות 8:30 ל – 15:30.  מס' טלפון:

08-9256362. מס' פקס: 02-6462505.

מזכירת ביה"ד (בכלא מעשיהו): גב' עפרה שרגא.

מזכירות הארצית של בתי הדין פועלת מלשכת היועץ המשפטי למשרד המשפטים ברחוב צלאח א-דין 29 ירושלים, ת.ד 49029, מיקוד 91490. מס' טלפון: 02-6466003. מס' פקס: 02-6467722.